现代古生物学和地层学国家重点实验室于2001年由国家科技部批准建设，其前身是1989年中国科学院批准成立的现代古生物学和地层学开放研究实验室，依托单位为中国科学院南京地质古生物研究所。这是我国专门从事古生物学和地层学研究的国家重点实验室，主要研究内容是地质历史时期生命的起源和演化过程及其环境背景等。自2000年以来，已经连续四次被评为国家优秀（A类）重点实验室。 

实验室现有固定成员99人，其中研究员45人，副研究员25人，助理研究员21人，技术支撑人员7人，行政秘书1人。实验室成员中包括中科院院士3人、973项目首席科学家3人。现有国家杰出青年基金获得者5人，百千万人才工程入选者4人，国家基金委创新群体3个，有十多位专家在国内外学术组织中担任主席、副主席、选举委员或理事长、副理事长、常务理事等职务，众多专家在国内外期刊任主编、副主编及编委，是一支名符其实的、老中青相结合的优秀科技团队。 

实验室拥有包括LEO1530VP型可变压场发射扫描电子显微镜、EVO-18型扫描电子显微镜、Oxford Aztec X-max 20型X射线能谱仪、VIX-M150型软X射线透射仪、LSM710型激光扫描共聚焦显微镜、ABI Prism 310全自动DNA遗传分析仪以及与从事同位素地球化学和生物标志化合物研究相关的MAT253同位素质谱仪、气相（液相）-串联四极杆质谱等十多台大型仪器设备。 

实验室的定位是利用我国独具特色的地层古生物资源，开展重大生物演化事件和精时地层的综合研究，保持一支具国际影响的科技队伍，建立国际一流的古生物学和地层学实验和数据平台，服务国家矿产资源的勘探，注重科教融合和科学传播。将实验室建设成为引领相关学科发展、在国内外具有重要影响的研究基地。 

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